Het toezicht op Nexstep valt onder de verantwoordelijkheid van de Raad van Commissarissen, geleid door zijn voorzitter. De commissarissen worden geleverd door NOGEPA (3) en EBN (2). Het Ministerie van Economische Zaken heeft een zetel als permanent waarnemer. Twee (2) andere zetels zijn gereserveerd voor geassocieerde leden. De huidige Raad van Commissarissen bestaat uit:
 

Jan Willem van Hoogstraten (voorzitter)	Menno Snel
Thijs Starink	Charles Fernandes
Lex de Groot	Ruud Cino
Sander Vergroesen

Belangrijke taken van de Raad van Commissarissen zijn het toezicht houden op het werkprogramma en de begroting, het installeren van commissies en het werven en begeleiden van de algemeen directeur.